Umumnya biaya manajemen proyek ini meliputi biaya SDM, biaya kehumasan dan koordinasi, dan biaya overhead lainnya. Biayabiaya yang telah dikeluarkan untuk pelaksanaan penugasan akan mendapatkan kompensasi dari Kementerian Keuangan ditambah dengan margin yang besarannya ditentukan setiap tahun. Biaya PDF dalam Penyiapan Infrastruktur KPBU Hijau